Carlos Jorge Ramírez Flores

Infectómica y Patogénesis Molecular

Investigador Cinvestav 2C

Laboratorio de interacciones hospedero-parásito número 42
Tel. +52 55 5747 3800 Ext. 5627
carlos.ramirezf@cinvestav.mx

Líneas de investigación

• Estudio de los factores de virulencia de T. gondii.
• Modelado de las interacciones hospedero-T. gondii mediante sistemas 3D.
• Infección oral de T. gondii y sus mecanismos de diseminación.

Proyectos relevantes

• Caracterización funcional de proteasas de T. gondii: degradación de componentes de matriz extracelular y de uniones intercelulares.
• Estudio de la motilidad del T. gondii en matrices biológicas.
• Modelado de la infección intestinal temprana de T. gondii y su diseminación en el hospedero mediante el uso de modelos 3D y el modelo animal.

Semblanza

El Dr. Carlos J. Ramírez Flores es originario de la ciudad de Xalapa, Veracruz. Se formó como biólogo en la Universidad Veracruzana (2008-2012), donde se graduó con honores. Se incorporó al Departamento de Bioquímica del Cinvestav, donde realizó sus estudios de Maestría (2013-2015) y Doctorado (2015-2019). En 2020, realizó una estancia postdoctoral en la University of Wisconsin-Madison en EUA, donde trabajó hasta 2024. Ese mismo año, el Dr. Ramírez se unió a la planta académica del Departamento de Infectómica y Patogénesis Molecular del Cinvestav.

Su investigación se ha centrado en entender la complejidad del parásito cosmopolita Toxoplasma gondii, contribuyendo al estudio de sus factores de virulencia y al desarrollo de modelos in vitro para estudiar la infección y diseminación del parásito. Su trabajo ha sido presentado en congresos nacionales e internacionales y ha publicado capítulos de libros, revisiones bibliográficas y artículos científicos en revistas internacionales de alto impacto. Es Candidato a Investigador Nacional del Sistema Nacional de Investigadoras e Investigadores (SNII).

Publicaciones recientes y/o relevantes

• Ramírez-Flores CJ, Hryckowian ND, Gale AN, Babatunde KA, Lares M, Beebe DJ, Kerr SC, Knoll LJ. Modeling Toxoplasma gondii-gut early interactions using a human microphysiological system. Accepted for its publication in PLOS Neglected Tropical Deseases. 2025 Jan.
• Hryckowian ND, Ramírez-Flores CJ, Zinda C, Park SC, Kelty MT, Knoll LJ. Host cell-specific metabolism of linoleic acid controls Toxoplasma gondii growth in cell culture. Infect Immun. 2024 Oct 15;92(10):e0029924. doi: 10.1128/iai.00299-24. Epub 2024 Aug 28. PMID: 39194219; PMCID: PMC11475615. https://journals.asm.org/doi/full/10.1128/iai.00299-24?rfr_dat=cr_pub++0pubmed&url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori%3Arid%3Acrossref.org
• Ramírez-Flores CJ, Erazo Flores BJ, Tibabuzo Perdomo AM, Barnes KL, Wilson SK, Mendoza Cavazos C, Knoll LJ. A Toxoplasma gondiilipoxygenase-like enzyme is necessary for virulence and changes localization associated with the host immune response. mBio. 2023 Oct 31;14(5):e0127923. doi: 10.1128/mbio.01279-23. Epub 2023 Aug 30. PMID: 37646522; PMCID: PMC10653942. https://journals.asm.org/doi/full/10.1128/mbio.01279-23?rfr_dat=cr_pub++0pubmed&url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori%3Arid%3Acrossref.org
• Ramírez-Flores CJ, Tibabuzo Perdomo AM, Gallego-López GM, Knoll LJ. Transcending Dimensions in Apicomplexan Research: from Two-Dimensional to Three-Dimensional In Vitro Cultures. Microbiol Mol Biol Rev. 2022 Jun 15;86(2):e0002522. doi: 10.1128/mmbr.00025-22. Epub 2022 Apr 12. PMID: 35412359; PMCID: PMC9199416. https://journals.asm.org/doi/10.1128/mmbr.00025-22?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%20%200pubmed
• Ramírez-Flores CJ, Knoll LJ. Breakthroughs in microbiology made possible with organoids. PLoS Pathog. 2021 Nov 24;17(11):e1010080. doi: 10.1371/journal.ppat.1010080. PMID: 34818378; PMCID: PMC8612533. https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1010080
• Ramírez-Flores CJ, Cruz-Mirón R, Lagunas-Cortés N, Mondragón-Castelán M, Mondragon-Gonzalez R, González-Pozos S, Mondragón-Flores R. Toxoplasma gondii excreted/secreted proteases disrupt intercellular junction proteins in epithelial cell monolayers to facilitate tachyzoites paracellular migration. Cell Microbiol. 2021 Mar;23(3):e13283. doi: 10.1111/cmi.13283. Epub 2020 Nov 10. PMID: 33108050. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/cmi.13283
• Ramírez-Flores CJ, Cruz-Mirón R, Mondragón-Castelán ME, González-Pozos S, Ríos-Castro E, Mondragón-Flores R. Proteomic and structural characterization of self-assembled vesicles from excretion/secretion products of Toxoplasma gondii. J Proteomics. 2019 Sep 30;208:103490. doi: 10.1016/j.jprot.2019.103490. Epub 2019 Aug 18. PMID: 31434009. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1874391919302623?via%3Dihub
• Ramírez-Flores CJ, Cruz-Mirón R, Arroyo R, Mondragón-Castelán ME, Nopal-Guerrero T, González-Pozos S, Ríos-Castro E, Mondragón-Flores R. Characterization of metalloproteases and serine proteases of Toxoplasma gondii tachyzoites and their effect on epithelial cells. Parasitol Res. 2019 Jan;118(1):289-306. doi: 10.1007/s00436-018-6163-5. Epub 2018 Dec 1. PMID: 30506516. https://link.springer.com/article/10.1007/s00436-018-6163-5

Actividades de divulgación

• “Elucidating the migration mechanisms of Toxoplasma gondii”. 2024. Department of Microbiology. Oregon State University. Corvallis, Oregon, USA.
• “Elucidating the migration mechanisms of Toxoplasma gondii”. 2024. Department of Biology. California State University-San Francisco, USA. Toxoplasmosis y salud: control and prevención”. 2023. Instituto de Salud Pública, Universidad Veracruzana.
• “Toxoplasma gondii, un parásito olvidado: diseminación por el hospedero y por el mundo”. 2023. Instituto de Salud Pública, Universidad Veracruzana.