• Mecanismos intrínsecos de interacción virus-huésped utilizando crustáceos.
• Virus de la mancha blanca (WSSV) en camarones peneidos y virus PaV1 en langosta espinosa Panurilus argus.
• Proteoma, transcriptoma y microbiobioma de los hospederos.

• Salud del medio ambiente.
• Biotecnología marina.

Estudio de los procesos y mecanismos que controlan la selección del hábitat en invertebrados bentónicos marinos: escalas de heterogeneidad, procesos hidrodinámicos, importancia relativa del espacio y del alimento sobre la producción bentónica.

• Desarrollo de la biotecnología para el cultivo integrado multitrófico de organismos acuáticos en sistemas cerrados con base en peces marinos, pepino y erizo de mar, macroalgas y plantas halófitas.
• Nutrición acuícola.
• Cultivo de tilapia.

• Taxonomía, ciclos de vida y ecología de parásitos de organismos acuáticos silvestres y cultivados.
• Patrones de trasmisión de parásitos en series de tiempo de largo plazo.
• Comunidades de bacterias y parásitos como indicadores de estrés ambiental.