Examen de Doctorado
Francisco Javier Córdoba Andrade
Les invitamos al examen final del M. en C. Francisco Javier Córdoba Andrade para obtener el grado de Doctorado en Biotecnología de Plantas
🗓️ viernes 22 de agosto
⏰ 14:00 Seminario público
⏰ 17:00 Lectura del acta
📍 Auditorio Unidad de Genómica Avanzada
Biotecnología de Plantas | Cinvestav Irapuato
Examen para obtener el grado de Doctorado que presenta:
M. en C. Francisco Javier Córdoba Andrade
"Amplificación isotérmica mediada por recombinación (RPA)para la detección de SARS-CoV-2, mediante proteínas de recombinación homóloga del bacteriófago T4"
Viernes 22 de agosto del 2025
14:00 horas SEMINARIO PUBLICO
17:00 horas LECTURA DEL ACTA Y AGRADECIMIENTOS
Auditorio: Unidad de Genómica Avanzada
DIRECTORES DE TESIS
Dr. Luis Gabriel Brieba de Castro
Dr. Agustino Martínez Antonio
COMITÉ TUTORIAL
Dr. Nayelli Marsch Martinez
Dr. Luis Eugenio González de la Vara
Dr. Robert Winkler
Dr. Luz Edith Casados-Vázquez
RESUMEN
La Amplificación por Polimerasa Recombinasa (RPA, por sus siglas en inglés) permite una amplificación rápida, exponencial e isotérmica de ácidos nucleicos sin necesidad de equipos especializados. Desde su desarrollo en 2006, la RPA se ha aplicado ampliamente para detectar cientos de objetivos de ARN y ADN, abarcando desde diagnósticos en el punto de atención hasta usos en la agricultura. Sin embargo, su dependencia de kits comerciales preensamblados limita la flexibilidad para la personalización. En este estudio, presentamos una alternativa de ciencia abierta a los kits comerciales de RPA, utilizando proteínas purificadas expresadas de manera heteróloga para adaptarse al usuario y evitar las proporciones molares fijas impuestas por los sistemas comerciales. Nuestro método incorpora enzimas derivadas de la vía de recombinación homóloga del bacteriófago T4, la proteína de unión a cadena sencilla (gp32), la recombinasa (UvsX) y el mediador (UvsY)—junto con la transcriptasa inversa del virus de la leucemia murina de Moloney (MMLV), mejorada en estabilidad térmica, y las ADN polimerasas Bst y Bsu. Evaluamos el impacto de la composición del tampón, las concentraciones de los reactivos y la temperatura de reacción utilizando genes sintéticos del SARS-CoV-2. De manera destacada, la concentración de gp32 y la composición del tampón surgieron como factores críticos para optimizar el rendimiento de la RPA. Utilizando este sistema personalizado, demostramos la detección exitosa del gen N del SARS-CoV-2 en dispositivos de flujo lateral (LFD) a partir de cADN de ocho muestras clínicas, obteniendo resultados consistentes con la RT-PCR.
Esta plataforma de RPA de ciencia abierta ofrece una alternativa adaptable y económica para investigadores, permitiendo la exploración de diversas condiciones experimentales y proporcionando una solución viable para quienes no tienen acceso a kits comerciales