Introducción
La bioinformática moderna requiere de herramientas algorítmicas robustas para estudiar los complejos mecanismos biológicos y analizar la creciente cantidad de datos. En esta primera edición del Workshop de Algoritmos en Bioinformática, organizada en el Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Unidad Irapuato, proponemos un enfoque práctico y profundo: entender los fundamentos matemáticos y computacionales así como explorar el diseño, aplicación y análisis de algoritmos fundamentales para el estudio de sistemas biológicos.
Dirigida a estudiantes, investigadores jóvenes y profesionales interesados en bioinformática, la escuela ofrecerá una serie de cursos intensivos centrados en los algoritmos detrás de temas clave como redes biológicas, metagenómica, alineamientos de secuencias, estructura secundaria del ARN, y reconstrucción de historias evolutivas. Más allá del uso de herramientas, nos enfocaremos en comprender la lógica y estructura de los métodos algorítmicos para un uso más consciente y efectivo.
Si vienes del área de las ciencias exactas y te interesa la biología, el WABio es para ti. Si vienes de las áreas de ciencias de la vida y tienes un fuerte y genuino interés por los algoritmos y las matemáticas, el WABio también es para ti.
Esperamos que esta semana de trabajo intenso permita a los participantes adentrarse en el corazón de los algoritmos bioinformáticos y fortalecer sus habilidades analíticas para proyectos de investigación de frontera.
Acerca de WABio 2025
La bioinformática moderna requiere de herramientas algorítmicas robustas para estudiar los complejos mecanismos biológicos y analizar la creciente cantidad de datos. En esta primera edición del Workshop de Algoritmos en Bioinformática, organizada en el Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Unidad Irapuato, proponemos un enfoque práctico y profundo: entender los fundamentos matemáticos y computacionales así como explorar el diseño, aplicación y análisis de algoritmos fundamentales para el estudio de sistemas biológicos.
Dirigida a estudiantes, investigadores jóvenes y profesionales interesados en bioinformática, la escuela ofrecerá una serie de cursos intensivos centrados en los algoritmos detrás de temas clave como redes biológicas, metagenómica, alineamientos de secuencias, estructura secundaria del ARN, y reconstrucción de historias evolutivas. Más allá del uso de herramientas, nos enfocaremos en comprender la lógica y estructura de los métodos algorítmicos para un uso más consciente y efectivo.
Si vienes del área de las ciencias exactas y te interesa la biología, el WABio es para ti. Si vienes de las áreas de ciencias de la vida y tienes un fuerte y genuino interés por los algoritmos y las matemáticas, el WABio también es para ti.
Esperamos que esta semana de trabajo intenso permita a los participantes adentrarse en el corazón de los algoritmos bioinformáticos y fortalecer sus habilidades analíticas para proyectos de investigación de frontera.
Objetivos del Workshop
- Entender los fundamentos matemáticos y computacionales de algoritmos clave en bioinformática.
- Explorar el diseño, la aplicación y el análisis de algoritmos fundamentales para el estudio de sistemas biológicos.
- Desarrollar una comprensión profunda de la lógica y estructura de los métodos algorítmicos.
- Fomentar un uso más consciente y efectivo de las herramientas bioinformáticas.
- Fortalecer las habilidades analíticas de los participantes para proyectos de investigación de frontera.
¿A Quién va Dirigido?
Este workshop está dirigido a:
- Estudiantes de licenciatura, maestría y doctorado.
- Investigadores jóvenes.
- Profesionales interesados en bioinformática.
- Personas del área de las ciencias exactas con interés en la biología.
- Personas de las áreas de ciencias de la vida con un fuerte y genuino interés por los algoritmos y las matemáticas.
Requisitos Previos
Se recomienda que los participantes tengan conocimientos básicos en:
- Matemáticas discretas
- Programación
- Estadística
- Inglés nivel intermedio (algunos cursos serán impartidos por instructores extranjeros).
Cronograma General del Workshop
El workshop se desarrollará del 27 de julio al 1 de agosto de 2025, cubriendo un tema principal por día:
- Lunes 28 de Julio: Ensamble de genomas y metagenomas (Curso C1)
- Martes 29 de Julio: Alineamientos y búsqueda de secuencias (Curso C2)
- Miércoles 30 de Julio: Reconstrucción de historias evolutivas (Curso C3)
- Jueves 31 de Julio: Estructuras secundarias del ARN (Curso C4)
- Viernes 1 de Agosto: Construcción e inferencia de redes (Curso C5)
Horario Detallado
A continuación, se presenta el horario detallado para cada día del workshop. Las actividades incluyen Ponencias Magistrales (P), Cursos (C), Trabajo Grupal (TG) y Presentación de Resultados (PR).
| Horas |
Domingo 27 |
Lunes 28 |
Martes 29 |
Miércoles 30 |
Jueves 31 |
Viernes 1 |
| 9:00-10:00 |
|
P1: Luz de María Bretón Deval |
P2: Steve Hoffmann |
P3: Rebeca Hernández |
P4: Peter Stadler |
P5: Deisy Gysi |
| 10:00-11:30 |
|
C1 |
C2 |
C3 |
C4 |
C5 |
| 11:30-12:00 |
|
Café |
| 12:00-2:00 |
|
C1 |
C2 |
C3 |
C4 |
C5 |
| 2:00-3:00 |
|
Comida |
| 3:00-4:30 |
|
TG1 |
TG2 |
TG3 |
TG4 |
TG5 |
| 4:30-6:00 |
Bienvenida y
Registro
|
PR1 |
PR2 |
PR3 |
PR4 |
PR5 |
TG: Trabajo grupal sobre problemas del curso.
PR: Presentación de resultados.
Cursos Ofrecidos
C1: Ensamble de genomas y metagenomas
Instructores: Elizabeth Cardenas / Shaday Guerrero
C2: Alineamientos y búsqueda de secuencias
Instructores: Amilcar Meneses
C3: Reconstrucción de historias evolutivas
Instructores: Maribel Hernández / José Antonio Ramírez
C4: Estructuras secundarias del ARN
Instructores: Peter Stadler / Katia Aviña
C5: Construcción e inferencia de redes
Instructores: Roberto Álvarez / Deisy Gysi
Ponencias Magistrales
Contaremos con la participación de destacados investigadores que ofrecerán ponencias magistrales:
- Lunes 28: Luz de María Bretón Deval, IBT-UNAM
- Martes 29: Steve Hoffmann, Instituto Leibniz para el Envejecimiento, Alemania
- Miércoles 30: Rebeca Hernández, Cinvestav Irapuato, México
- Jueves 31: Peter Stadler, Universidad de Leipzig, Alemania
- Viernes 1: Deisy Gysi, Universidad Federal de Paraná, Brasil
Nota: Los temas específicos de las ponencias se anunciarán próximamente.
Ponentes e Instructores
Conoce a los expertos que compartirán sus conocimientos y experiencia durante el WABio 2025.
Deisy Gysi
Afiliación: Universidad Federal de Paraná, Brasil
Página
Roberto Álvarez
Afiliación: Universidad Autónoma de Querétaro
Página
Elizabeth Cadenas
Afiliación: Cinvestav Irapuato, México
Página
Shaday Guerrero
Afiliación: Cinvestav Irapuato, México
Página
Luz de María Bretón Deval
Afiliación: IBT-UNAM
Página
Amilcar Meneses
Afiliación: Cinvestav, México
Página
Steve Hoffmann
Afiliación: Instituto Leibniz para el Envejecimiento, Alemania
Página
Peter Stadler
Afiliación: Universidad de Leipzig, Alemania
Página
Rebeca Hernández
Afiliación: Cinvestav Irapuato, México
Página
José Antonio Ramírez
Afiliación: Max Planck Institute & Cinvestav Irapuato
Página
Maribel Hernández Rosales
Afiliación: Cinvestav Irapuato, México
Página
Katia Aviña Padilla
Afiliación: Cinvestav Irapuato, México
Página
.
Proceso de Inscripción
¡Asegura tu lugar en el Workshop on Algorithms in Bioinformatics WABio 2025! Sigue los pasos a continuación para registrarte.
Información Clave:
- Enlace de Registro: Inscríbete Aquí (Google Forms)
- Fecha Límite de Inscripción: 27 de junio de 2025
- Fecha de aviso de aceptación: 4 de julio de 2025
- Fecha límite para confirmar tu participación: 11 de julio de 2025
- Cupo Limitado: 40 personas
- Costo de Inscripción: 1000 MXN
- Becas: Se ofrecerán alimentación para todos los participantes (más información durante el proceso de selección).
Requisitos de Conocimientos (Recordatorio):
Para aprovechar al máximo el workshop, se recomienda tener conocimientos básicos en:
- Matemáticas discretas
- Programación
- Estadística
- Inglés nivel intermedio (algunos cursos serán impartidos por instructores extranjeros).
Pasos para Inscribirte:
- Revisa toda la información del workshop en este sitio web (Acerca de, Programa, Ponentes).
- Asegúrate de cumplir con los requisitos de conocimientos previos.
- Haz clic en el enlace de registro para acceder al formulario oficial en Google Forms.
- Completa todos los campos del formulario con información veraz y actualizada.
- Envía tu solicitud antes de la fecha límite (27 de junio de 2025).
- Espera la confirmación de aceptación y las instrucciones para el pago y detalles sobre becas.
Si tienes alguna duda sobre el proceso de inscripción, no dudes en contactarnos: wabio.cinvestav@gmail.com.
Equipo Organizador y Colaboradores
El Workshop on Algorithms in Bioinformatics WABio 2025 es posible gracias al esfuerzo y dedicación de un talentoso equipo de profesionales y estudiantes. A continuación, presentamos a nuestros ayudantes y colaboradores principales:
Ayudantes del Workshop
- Anton Paskhov, ENES Morelia
- Rafael Hernández, CCM Morelia
- Karina Torres, CIC, IPN
- Brenda Noguez, CIC, IPN
- Diego Noguez, CIC, IPN
- Karyme Azpeitia, FC, UNAM
- Andrea Quiroz, UAQ
- J. Antonio Ramírez, Cinvestav Irapuato
- Elizabeth Cadenas, Cinvestav Irapuato
- Shaday Guerrero, Cinvestav Irapuato
Organizadores
- Maribel Hernández Rosales, Cinvestav Irapuato
- Shaday Guerrero Flores, Cinvestav Irapuato
Agradecemos profundamente su compromiso y entusiasmo para hacer de este workshop una experiencia enriquecedora para todos los participantes.
Sede del Evento
El Workshop on Algorithms in Bioinformatics WABio 2025 se llevará a cabo en las instalaciones del:
Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN (Cinvestav), Unidad Irapuato.
Dirección: Km. 9.6 Libramiento Norte Carretera Irapuato-León, Apartado Postal 629, C.P. 36824, Irapuato, Guanajuato, México.
Información sobre Cinvestav Irapuato:
El Cinvestav Irapuato fue fundado en 1981 con la idea de conformar un grupo vanguardista en investigación, realizamos investigación en ecología, genómica y evolución, biología computacional, biotecnología y bioinformática. Te invitamos a conocernos: https://www.cinvestav.mx/irapuato
¿Cómo Llegar?
Información detrallada en breve
Mapa de Ubicación:
Hospedaje Sugerido:
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Información de Contacto
Para cualquier duda, consulta o información adicional sobre el WABio 2025, por favor contáctanos a través del siguiente correo electrónico:
Correo Electrónico Oficial: wabio.cinvestav@gmail.com
Estaremos encantados de atenderte.