Jesús Valdés Flores

Bioquímica

Investigador Titular Cinvestav 3C

SNII - II

Metabolismo del RNA
Laboratorio  11

55 5747 3800 ext. 5228
jvaldes@yupisnoopydoopytroopicinvestav.mx

Líneas de investigación

• Metabolismo del pre-mRNA
• RNAs no codficantes
• RNAs circulares
• Modificaciones epigenéticas del RNA
• Interacciones RNA-proteínas

Proyectos Relevantes

• Identificación de funciones de RNAs circulares en Entamoeba histolytica y en el enquistamiento de Entamoeba invadens
• RNAs circulares en vesículas extracelulares amebianas
• Mecanismos de procesamiento de RNAs mensajeros y no codificantes en Entamoeba

Semblanza

• Doctor en Ciencias por el DGBM-CINVESTAV
• Describí los primeros cariotipos moleculares de Entamoeba histolytica y E. invadens. Determiné la tasa de mutación basal de Trypanosoma brucei
• Caractericé las señales y mecanismos de splicing de transcritos marcadores de cáncer de pulmón y de uniones intercelulares.
• Descubrimos RNAs circulares asociados a la virulencia en Entamoeba
• Describimos el mecanismo de retención intrónica en E. histolytica mediado por un factor de splicing constitutivo

Publicaciones recientes y/o relevantes

• Patricia Cuellar, Elizabeth J. Castañeda-Ortiz, César Rosales-Zarza, Carlos E. Martínez-Rodríguez, Israel Canela-Pérez, Mario Alberto Rodríguez, Jesús Valdés and Elisa Azuara-Liceaga. Genome-Wide Classification of Myb Domain-Containing Protein Families in Entamoeba invadens. Genes 2024, 15, 201.  doi:  10.3390/genes15020201
• Mario Ángel López-Luis, Cristian Julio César Padrón-Manrique, Jesús Alberto García-Lerena, Daniela Lozano-Amado, Rosaura Hernández-Rivas, Odila Saucedo-Cárdenas, Alfonso Méndez-Tenorio, and Jesús Valdés. In Silico Identification and Characterization of circRNAs as Potential Virulence-Related miRNA/siRNA Sponges from Entamoeba histolytica and Encystment-Related circRNAs from Entamoeba invadens. Non-Coding RNA 2022, 8(5), 65;  doi:  10.3390/ncrna8050065
• Gretter González-Blanco, José Manuel Jáuregui-Wade, Tea Anastasia Ruiz-Luis, Yumiko Saito-Nakano and Jesús Valdés. Old Circular RNAs, New Habits: Repurposing Noncoding RNAs in Parasitic Amebozoa. Front. Sys. Biol. 04 july 2022, 951295.  doi:  10.3389/fsysb.2022.951295
• Gretter González-Blanco, Guillermina García-Rivera, Patricia Talmás-Rohana, Ester Orozco, José Manuel Galindo-Rosales, Cristina Vélez, Odila Salucedo-Cárdenas, Elisa Azuara-Liceaga, Mario Alberto Rodríguez-Rodríguez, Tomoyoshi Nozaki and Jesús Valdés. An Unusual U2AF2 Inhibits Splicing and Attenuates the Virulence of the Human Protozoan Parasite Entamoeba histolytica. Front. Cell. Infect. Microbiol. 17 june 2022, 888428.  doi:  10.3389/fcimb.2022.888428
• Salinas-Vera, Y.M. Valdés, J.; Hidalgo-Miranda, A.; Cisneros-Villanueva, M.; Marchat, L.A.; Nuñez-Olvera, S.I.; Ramos-Payán, R.; Pérez-Plasencia, C.; Arriaga-Pizano, L.A.; Prieto-Chávez, J.L.; López-Camarillo, C. Three-Dimensional Organotypic Cultures Reshape the microRNAs Transcriptional Program in Breast Cancer Cells. Cancers 2022, 14, 2490.  doi:  10.3390/cancers14102490
• Jesús Alberto García-Lerena, Gretter González-Blanco, Odila Saucedo-Cárdenas Jesús Valdés. Promoter-Bound Full-Length Intronic Circular RNAs-RNA Polymerase II Complexes Regulate Gene Expression in the Human Parasite Entamoeba histolytica. non-Coding RNA. 2022 jan 27; 8(1):12.  doi:  10.3390/ncrna8010012
• José Manuel Jáuregui-Wade, Jorge Cerbón-Solórzano, Ricardo Avila-García, Jorge Tonatiuh Ayala-Sumuano, Jesús Valdés. Ceramide synthase 2 knockdown suppresses trophozoite growth, migration, in vitro encystment and excystment of Entamoeba invadens. Biochem Biophys Res Commun. 2020 Mar 26; 524(1):135-141.  doi:  10.1016/j.bbrc.2020.01.093
• Ricardo Avila-García, Jesús Valdés, José Manuel Jáuregui-Wade, Jorge Tonatiuh Ayala-Sumuano, Jorge Cerbón-Solórzano. The metabolic pathway of sphingolipids biosynthesis and signaling in Entamoeba histolytica. Biochem Biophys Res Commun. 2020 Feb 12; 522(3):574-579.  doi:  10.1016/j.bbrc.2019.11.116