Examen de Maestría
Luis Felipe Hernández Ramírez
Les invitamos al examen final del LBM. Luis Felipe Hernández Ramírez para obtener el grado de Maestría en Biología Integrativa
Viernes 10 de enero
12:00 Seminario público
13:00 Lectura del acta
Auditorio Manuel Ortega, Unidad Irapuato
Biología Integrativa | Cinvestav Irapuato
Examen para obtener el grado de Maestría que presenta:
LBM. Luis Felipe Hernández Ramírez
"Primer estudio de la regeneración en el gasterópodo terrestre Deroceras laeve utilizando transcriptómica y bioinformática"
Viernes 10 de enero de 2025
SEMINARIO PUBLICO 11:00 hrs
LECTURA DEL ACTA Y AGRADECIMIENTOS 12:00 hrs
Auditorio Dr. Manuel Ortega Ortega
Cinvestav Unidad Irapuato
DIRECTORES DE TESIS
Dra. Maribel Hernández Rosales
Dr. Alfredo Varela Echavarría
COMITÉ TUTORIAL
Dr. Luis Alfredo Cruz Ramírez
Dr. Luis José Delaye Arredondo
RESUMEN
La regeneración animal es un fenómeno biológico fascinante que permite a ciertos organismos restaurar tejidos, estructuras u órganos perdidos o dañados. A pesar de su amplia diversidad en el reino animal, los estudios sobre regeneración se han centrado principalmente en unos pocos organismos modelo, como el axolotl, el pez cebra, hidra y especies de planaria. Sin embargo, con el fin de expandir nuestro conocimiento acerca de este proceso en moluscos del que se conoce muy poco, en esta investigación nos enfocamos en un nuevo organismo, el gasterópodo terrestre Deroceras laeve. Para ello utilizamos diferentes estrategias Bioinformáticas como transcriptómica, construcción y análisis de redes de interacción proteína-proteína, identificación de ortólogos y homologación de anotaciones funcionales mediante técnicas de agrupamiento basadas en la extracción de características matemáticas. Esto fue aplicado a datos de experimentos de RNA-seq de la regeneración de la cola tras su amputación.
Así, generamos el primer transcriptoma para la especie D. laeve, el cual fue útil para la identificación de genes que están involucrados en regeneración en otras especies y genes que tienen poca o nula caracterización. Entre ellos, algunos que presumimos podrían ser únicos de D. laeve y especies cercanas de gasterópodos. Para este grupo identificamos enriquecimientos funcionales por asociación en la organización de la matriz extracelular y la respuesta inmune. Además, descubrimos que un alto porcentaje de las proteínas codificadas por los genes diferencialmente expresados a la alta son proteínas desordenadas, con un posible papel en la axogénesis y la formación de un centro organizador similar a la capa epidérmica apical observada en otros modelos de regeneración cuya consecuencia es la iniciación y mantenimiento de este proceso. De esta forma, este trabajo suma a nuestra comprensión sobre los mecanismos moleculares que subyacen a las primeras etapas del fenómeno de la regeneración animal en este organismo no modelo. Además, el hallazgo de proteínas sin función conocida que logramos asociar con un posible rol en la organización de matriz extracelular abre nuevas vías que podrían revelar adaptaciones evolutivas para la regeneración en los moluscos.