WABio 2025

 

 

Workshop on Algorithms in Bioinformatics
Cinvestav Irapuato, 27 de julio – 1 de agosto, 2025
 

 

 

 

  

Introducción


La bioinformática moderna requiere de herramientas algorítmicas robustas para estudiar los complejos mecanismos biológicos y analizar la creciente cantidad de datos. En esta primera edición del Workshop de Algoritmos en Bioinformática, organizada en el Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Unidad Irapuato, proponemos un enfoque práctico y profundo: entender los fundamentos matemáticos y computacionales así como explorar el diseño, aplicación y análisis de algoritmos fundamentales para el estudio de sistemas biológicos.

Dirigida a estudiantes, investigadores jóvenes y profesionales interesados en bioinformática, la escuela ofrecerá una serie de cursos intensivos centrados en los algoritmos detrás de temas clave como redes biológicas, metagenómica, alineamientos de secuencias, estructura secundaria del ARN, y reconstrucción de historias evolutivas. Más allá del uso de herramientas, nos enfocaremos en comprender la lógica y estructura de los métodos algorítmicos para un uso más consciente y efectivo.

Si vienes del área de las ciencias exactas y te interesa la biología, el WABio es para ti. Si vienes de las áreas de ciencias de la vida y tienes un fuerte y genuino interés por los algoritmos y las matemáticas, el WABio también es para ti.

Esperamos que esta semana de trabajo intenso permita a los participantes adentrarse en el corazón de los algoritmos bioinformáticos y fortalecer sus habilidades analíticas para proyectos de investigación de frontera.

 

Acerca de WABio 2025



La bioinformática moderna requiere de herramientas algorítmicas robustas para estudiar los complejos mecanismos biológicos y analizar la creciente cantidad de datos. En esta primera edición del Workshop de Algoritmos en Bioinformática, organizada en el Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Unidad Irapuato, proponemos un enfoque práctico y profundo: entender los fundamentos matemáticos y computacionales así como explorar el diseño, aplicación y análisis de algoritmos fundamentales para el estudio de sistemas biológicos.

Dirigida a estudiantes, investigadores jóvenes y profesionales interesados en bioinformática, la escuela ofrecerá una serie de cursos intensivos centrados en los algoritmos detrás de temas clave como redes biológicas, metagenómica, alineamientos de secuencias, estructura secundaria del ARN, y reconstrucción de historias evolutivas. Más allá del uso de herramientas, nos enfocaremos en comprender la lógica y estructura de los métodos algorítmicos para un uso más consciente y efectivo.

Si vienes del área de las ciencias exactas y te interesa la biología, el WABio es para ti. Si vienes de las áreas de ciencias de la vida y tienes un fuerte y genuino interés por los algoritmos y las matemáticas, el WABio también es para ti.

Esperamos que esta semana de trabajo intenso permita a los participantes adentrarse en el corazón de los algoritmos bioinformáticos y fortalecer sus habilidades analíticas para proyectos de investigación de frontera.


Objetivos del Workshop

  • Entender los fundamentos matemáticos y computacionales de algoritmos clave en bioinformática.
  • Explorar el diseño, la aplicación y el análisis de algoritmos fundamentales para el estudio de sistemas biológicos.
  • Desarrollar una comprensión profunda de la lógica y estructura de los métodos algorítmicos.
  • Fomentar un uso más consciente y efectivo de las herramientas bioinformáticas.
  • Fortalecer las habilidades analíticas de los participantes para proyectos de investigación de frontera.

¿A Quién va Dirigido?

Este workshop está dirigido a:

  • Estudiantes de licenciatura, maestría y doctorado.
  • Investigadores jóvenes.
  • Profesionales interesados en bioinformática.
  • Personas del área de las ciencias exactas con interés en la biología.
  • Personas de las áreas de ciencias de la vida con un fuerte y genuino interés por los algoritmos y las matemáticas.

Requisitos Previos
Se recomienda que los participantes tengan conocimientos básicos en:

  • Matemáticas discretas
  • Programación
  • Probabilidad
  • Estadística

Cronograma General del Workshop

El workshop se desarrollará del 27 de julio al 1 de agosto de 2025, cubriendo un tema principal por día:

  • Lunes 28 de Julio: Ensamble de genomas y metagenomas (Curso C1)
  • Martes 29 de Julio: Alineamientos y búsqueda de secuencias (Curso C2)
  • Miércoles 30 de Julio: Reconstrucción de historias evolutivas (Curso C3)
  • Jueves 31 de Julio: Estructuras secundarias del ARN (Curso C4)
  • Viernes 1 de Agosto: Construcción e inferencia de redes (Curso C5)

Horario Detallado
A continuación, se presenta el horario detallado para cada día del workshop. Las actividades incluyen Ponencias Magistrales (P), Cursos (C), Trabajo Grupal (TG) y Presentación de Resultados (PR).

Horas Lunes 28 Martes 29 Miércoles 30 Jueves 31 Viernes 1
9:00-10:00 P1: Luz de María Bretón Deval P2: Steve Hoffmann P3: Rebeca Hernández P4: Peter Stadler P5: Deisy Gysi
10:00-11:30 C1 C2 C3 C4 C5
11:30-12:00 Café
12:00-2:00 C1 C2 C3 C4 C5
2:00-3:00 Comida
3:00-4:30 TG1 TG2 TG3 TG4 TG5
4:30-6:00 PR1 PR2 PR3 PR4 PR5

TG: Trabajo grupal sobre problemas del curso.

PR: Presentación de resultados.


Cursos Ofrecidos

C1: Ensamble de genomas y metagenomas
Instructores: Elizabet Cardenas / Shaday Guerrero
Descripción del curso C1 (placeholder)...

C2: Alineamientos y búsqueda de secuencias
Instructores: Amílcar Meneses
Descripción del curso C2 (placeholder)...

C3: Reconstrucción de historias evolutivas
Instructores: Maribel Hernández / Antonio
Descripción del curso C3 (placeholder)...

C4: Estructuras secundarias del ARN
Instructores: Peter Stadler / Katia Aviña Padilla
Descripción del curso C4 (placeholder)...

C5: Construcción e inferencia de redes
Instructores: Roberto Álvarez / Alumna / Deisy Gysi
Descripción del curso C5 (placeholder)...


Ponencias Magistrales
Contaremos con la participación de destacados investigadores que ofrecerán ponencias magistrales:

  • Lunes 28: Luz de María Bretón Deval (Tema por confirmar)
  • Martes 29: Steve Hoffmann (Tema por confirmar)
  • Miércoles 30: Rebeca Hernández (Tema por confirmar)
  • Jueves 31: Peter Stadler (Tema por confirmar)
  • Viernes 1: Deisy Gysi (Tema por confirmar)

Nota: Los temas específicos de las ponencias se anunciarán próximamente.

Ponentes e Instructores



Conoce a los expertos que compartirán sus conocimientos y experiencia durante el WABio 2025.

Deisy Gysi (TALK)
Afiliación: Universidad de Curitiba, Brasil
Participación: Ponencia Magistral (Redes), Curso C5 (Construcción e inferencia de redes)
Biografía (placeholder)...


Roberto Álvarez
Afiliación: Universidad Autónoma de Querétaro
Participación: Curso C5 (Construcción e inferencia de redes)
Biografía (placeholder)...


Elizabeth Cadenas
Afiliación: Cinvestav Irapuato, México
Participación: Curso C3 (Ensamble de genomas y metagenomas)
Biografía (placeholder)...


Shaday Guerrero
Afiliación: Cinvestav Irapuato
Participación: Curso C3 (Ensamble de genomas y metagenomas)
Biografía (placeholder)...


Luz de María Bretón Deval (TALK)
Afiliación: IBT-UNAM
Participación: Ponencia Magistral (Metagenómica)
Biografía (placeholder)...


Amilcar Meneses
Afiliación: Cinvestav, México
Participación: Curso C1 (Alineamientos y búsqueda de secuencias)
Biografía (placeholder)...


Steve Hoffmann (TALK)
Afiliación: Instituto Leibniz para el Envejecimiento, Alemania
Participación: Ponencia Magistral (Alineamientos), Curso C1 (Alineamientos y búsqueda de secuencias - por confirmar ponente P1)
Biografía (placeholder)...


Peter Stadler (TALK)
Afiliación: Universidad de Leipzig, Alemania
Participación: Ponencia Magistral (RNA), Curso C2 (Estructuras secundarias del ARN)
Biografía (placeholder)...


Rebeca Hernández (TALK)
Afiliación: Cinvestav Irapuato
Participación: Ponencia Magistral (Evolución)
Biografía (placeholder)...


José Antonio Ramírez
Afiliación: Max Planck Institute & Cinvestav Irapuato
Participación: Curso C4 (Reconstrucción de historias evolutivas)
Biografía (placeholder)...


Maribel Hernández Rosales
Afiliación: Cinvestav Irapuato
Participación: Curso C4 (Reconstrucción de historias evolutivas)
Biografía (placeholder)...


Verónica Jiménez (TALK)
Afiliación: (Por confirmar)
Participación: Ponencia Magistral (Lunes 28)
Biografía (placeholder)...


Haydeé (?)
Afiliación: (Por confirmar)
Participación: Curso C1 (Alineamientos y búsqueda de secuencias)
Biografía (placeholder)...


Katia (?)
Afiliación: (Por confirmar)
Participación: Curso C2 (Estructuras secundarias del ARN)
Biografía (placeholder)...


Antonio (?)
Afiliación: (Por confirmar)
Participación: Curso C4 (Reconstrucción de historias evolutivas)
Biografía (placeholder)...


Foto Alumna
Alumna (?)
Afiliación: (Por confirmar)
Participación: Curso C5 (Construcción e inferencia de redes)
Biografía (placeholder)...


Nota: Se solicitará a cada ponente e instructor una breve biografía (2-4 líneas) y una fotografía para completar esta sección.

Proceso de Inscripción


¡Asegura tu lugar en el Workshop on Algorithms in Bioinformatics WABio 2025! Sigue los pasos a continuación para registrarte.

Información Clave:

  • Enlace de Registro: Inscríbete Aquí (Google Forms)
  • Fecha Límite de Inscripción: 22 de junio de 2025
  • Cupo Limitado: 40 personas
  • Costo de Inscripción: 1000 MXN
  • Becas: Se ofrecerán becas de alimentación y transporte (más información durante el proceso de selección).

Requisitos de Conocimientos (Recordatorio):

Para aprovechar al máximo el workshop, se recomienda tener conocimientos básicos en:

  • Matemáticas discretas
  • Programación
  • Estadística

Pasos para Inscribirte:

  1. Revisa toda la información del workshop en este sitio web (Acerca de, Programa, Ponentes).
  2. Asegúrate de cumplir con los requisitos de conocimientos previos.
  3. Haz clic en el enlace de registro para acceder al formulario oficial en Google Forms.
  4. Completa todos los campos del formulario con información veraz y actualizada.
  5. Envía tu solicitud antes de la fecha límite (22 de junio de 2025).
  6. Espera la confirmación de aceptación y las instrucciones para el pago (si aplica) y detalles sobre becas.

Si tienes alguna duda sobre el proceso de inscripción, no dudes en contactarnos.

 

Equipo Organizador y Colaboradores



El Workshop on Algorithms in Bioinformatics WABio 2025 es posible gracias al esfuerzo y dedicación de un talentoso equipo de profesionales y estudiantes. A continuación, presentamos a nuestros ayudantes y colaboradores principales:

Ayudantes del Workshop

  • Anton Paskhov (ENES Morelia)
  • Rafael Hernández (CCM Morelia)
  • Karina Torres (CIC, IPN)
  • Brenda Noguez (CIC, IPN)
  • Diego Noguez (CIC, IPN)
  • Karyme Azpeitia (FC, UNAM)
  • Andrea Quiroz (UAQ)
  • J. Antonio Ramírez (Cinvestav Irapuato)
  • Elizabeth Cadenas (Cinvestav Irapuato)
  • Shaday Guerrero (Cinvestav Irapuato)

Agradecemos profundamente su compromiso y entusiasmo para hacer de este workshop una experiencia enriquecedora para todos los participantes.

 

Sede del Evento


El Workshop on Algorithms in Bioinformatics WABio 2025 se llevará a cabo en las instalaciones del:

Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN (Cinvestav), Unidad Irapuato.

Dirección: Km. 9.6 Libramiento Norte Carretera Irapuato-León, Apartado Postal 629, C.P. 36824, Irapuato, Guanajuato, México.

Descripción del Cinvestav Irapuato:
(Placeholder: Breve descripción de la unidad Irapuato del Cinvestav, sus instalaciones relevantes para el evento, etc.)

¿Cómo Llegar?
(Placeholder: Instrucciones detalladas sobre cómo llegar a Cinvestav Irapuato en transporte público, vehículo particular, desde el aeropuerto más cercano, etc.)

Mapa de Ubicación:
(Aquí se integrará un mapa interactivo de Google Maps con la ubicación del Cinvestav Irapuato)

Hospedaje Sugerido:
(Placeholder: Lista de hoteles cercanos recomendados, con diferentes rangos de precios, información de contacto o enlaces a sus sitios web.)


Información de Contacto
Para cualquier duda, consulta o información adicional sobre el WABio 2025, por favor contáctanos a través del siguiente correo electrónico:

Correo Electrónico Oficial: wabio.cinvestav@gmail.com

Estaremos encantados de atenderte.

 

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Contacto: wabio.cinvestav@gmail.com.

 


 

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