La investigación científica del departamento esta constituido por cinco Programas de Investigación:
Estas actividades se orientan al diseño y experimentación de sistemas de producción controlada de organismos acuáticos con fines de autoconsumo y/o comercialización, así como a la generación de estrategias e instrumentos bio-socio-económicos para el uso y manejo de los recursos y la planificación del desarrollo de las pesquerías.
La producción de peces y las grandes pesquerías de la región son de gran importancia en la generación de alimento para consumo, así como por la fuente de divisas y de empleo para los pescadores de la zona costera. La captura de la langosta es la tercera pesquería más importante del Golfo de México.
El objetivo es generar y aplicar el conocimiento para el manejo integrado de la ZCT, y desarrollar tecnologías para el aprovechamiento de sus recursos naturales, incluyendo la generación de estrategias para la rehabilitación, mejoramiento y remediación de hábitats críticos, generación de instrumentos bio-socio-económicos para el uso y manejo de los recursos naturales.
El estudio integrado de la ZCT nos permite planificar estrategias para tratar de rehabilitar habitáts críticos así como para evitar desastres ecológicos costeros.
- IMPACTO Y SALUD AMBIENTAL
Su objetivo principal de este programa, es identificar indicadores y desarrollar herramientas para el diagnóstico y seguimiento ambiental de la ZCT, a través de la determinación de la concentración de sustancias toxicas en agua, sedimento y organismos, así como su flujo en los ecosistemas; estudio de los factores que influyen sobre el estado trófico de la zona costera, y la evaluación de las respuestas bioquímicas, moleculares y fisiológicas en los organismos a nivel individual, poblacional y de comunidades, como respuesta a factores de estrés ambiental.
La salud de los diferentes ecosistemas acuáticos son uno de los grandes objetivos de estudio de nuestro departamento en donde se ha trabajado conjuntamente con diferentes dependencias gubernamentales y paraestatales en programas de monitoreo ambiental en el Golfo de México. (Proyecto Xcambó-2 PEMEX- CINVESTAV)
- BIOLOGÍA MARINA Y OCEANOGRAFÍA
Tiene como objetivo estudiar los procesos físicos, químicos y biológicos que determinan la estructura y función de la ZCT, a través de los procesos hidrodinámicos que controlan los cambios en la geomorfología costera, que permitan explicar las variaciones espaciales y temporales en la estructura, organización y producción de las comunidades bióticas que la componen.
El estudio de los procesos Físico-Químicos-Biológicos de una forma integrada en la zona costera y oceánica, son parte fundamental de los proyectos de investigación del departamento.
El objetivo principal de este programa, es determinar la estructura biológica de la ZCT, mediante el estudio de sus comunidades bióticas, sus relaciones filogenéticas, y su composición y abundancia, en las diferentes escalas espaciales y temporales.
La diversidad de las diferentes especies de organismos en los arrecifes de coral del caribe mexicano son un objetivo más de las investigaciones realizadas en nuestro departamento.